Latar belakang pendidikan Program Studi Kesehatan Lingkungan (Polibara) merupakan satu-satunya program studi yang ada di perguruan tinggi seluruh Indonesia, oleh karena satu-satunya dan merupakan program studi unggulan, maka produk lulusannya harus mempunyai kompetensi yang khas dan dapa diunggulkan, terutama tentang hal-hal praktis terkait dengan pengnedalian vektor dan menyakit malaria. Laboratorium merupakan sarana untuk memenuhi kebutuhan tersebut untuk itu program Studi Kesehatan Lingkungan Politeknik Banjarnegara (Polibara) dilengkapi laboratorium yang terdiri dari 1 unit gedung dengan luas 24m x17m , dengan 4 ruangan. Masing-masing berukuran 11m x 7m. Yang di dalamnya meliputi:

a. Lab Kesehatan Lingkungan
Tata ruang gedung(Fiska air, kimia air, Pembuangan tinja dan Air limbah, Penyehatan Makanan dan Minuman serta sanitasi tempat-tempat umum).

b. Lab Malariologi
Mampu mengidentifikasi, memberantas Vektor nyamuk

c. Lab Parasitologi
Mampu mengidentifikasi Plasmodium malaria (Faciparum, Vivax, Malariae dan Ovale)Cacing (Mikro filaria dan Cacing perut).

d. Lab Entomologi
- Mampu mengidentifikasi spesie nyamuk
- Pembedahan nyamuk untuk menentukan Parous/Nulli parous
- Pembedahan indung telur (Ovary gland) dan kelenjar ludah (Salivary gland)
- Menentukan umur individu maupun umur populasi nyamuk
- Pemeliharaan hewan uji (rearing)

e.Lab Sistem Informasi Geografis (SIG)
Pemetaan dan analisis spatial

e. Lab Pengedalian vektor.
-Menentukan bionomik vektor
-Menghitung kepadatan nyamuk, baik Man Hour Density (MHD) maupun Man Biting Rate (MBR)
-Menentukan tempat perkemangbiakan nyamuk dan menghitung kepadatan larva.
-Mengaplikasikan beberapa metode pengedalian larva maupun pengendalian vektor dewasa secara kimiawi